I fagi, o batteriofagi, rappresentano la componente più abbondante del viroma intestinale umano.
Questi virus, che infettano specificamente i batteri, svolgono un ruolo fondamentale nel modellare le comunità batteriche del nostro intestino e nel regolarne le funzioni. Nel microbiota intestinale i fagi contribuiscono in modo significativo alla regolazione delle popolazioni batteriche, favorendone la diversità genetica e stimolandone la crescita. Le loro interazioni con i batteri ospiti seguono principalmente due cicli di vita: quello litico, in cui il fago distrugge il batterio rilasciando nuove particelle virali, e quello lisogenico, in cui il materiale genetico del fago si integra nel genoma batterico sotto forma di profago. È interessante notare come i fagi lisogenici possano rappresentare fino al 20% del genoma batterico e svolgano un ruolo attivo nella colonizzazione intestinale (particolarmente importante nei primi mesi di vita). I fagi possono influenzare la patogenicità batterica attraverso diversi meccanismi: eliminando direttamente i batteri patogeni, modulando l'espressione dei fattori di virulenza o la resistenza agli antibiotici.
A differenza degli antibiotici ad ampio spettro, che causano modificazioni multiple e durature del microbiota intestinale, i fagi agiscono in modo specifico su particolari ceppi o specie batteriche. Questa specificità apre prospettive interessanti per la fagoterapia, un approccio terapeutico che utilizza i fagi per trattare infezioni batteriche, particolarmente promettente nell'era della resistenza agli antibiotici. C'è ancora tanto da fare e da studiare, è un campo molto interessante: comprendere le complesse dinamiche tra fagi e batteri intestinali è essenziale per far progredire le nostre conoscenze sull'ecologia del microbiota e per sviluppare strategie terapeutiche innovative. https://www.larevuedesmicrobiotes.com/issues/phages-phagotherapy-gut-microbiota